图书介绍
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- 胡松年，薛庆中主编 著
- 出版社： 杭州：浙江大学出版社
- ISBN：7308033058
- 出版时间：2003
- 标注页数：225页
- 文件大小：43MB
- 文件页数：237页
- 主题词：基因组－数据－分析－手册
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图书目录
目 录1
第1章 大规模基因组测序策略与技术 胡松年1
1.1大规模基因组测序的常用技术1
1.2大规模测序的策略4
1.3逐步克隆法测序策略6
1.4全基因组霰弹法测序策略14
1.5大规模基因组测序的现状与发展趋势16
第2章生物信息数据库 叶琳19
2.1文献检索19
2.2核酸序列数据库检索24
2.3基因组序列数据库检索41
2.4氨基酸序列数据库43
2.5蛋白质结构数据库PDB43
2.6疾病相关基因数据库44
第3章序列联配（BLAST、SIM4） 叶杰华董坚海46
3.1 Blast46
3.2 Sim458
第4章 多序列联配（Clustal W） 张兵61
4.1 Clustal简介61
4.2 目 的61
4.3原理62
4.4步骤62
4.5结果及分析69
第5章测序分析软件（Phred/Phrap/Consed） 王建斌 贾 佳73
5.1 Phred碱基读取程序73
5.2 Phrap序列组装程序79
5.3 Consed图形化视图82
6.1 EST通道化分析系统（EST Analysis Pipeline SystemTM）90
第6章EST序列分析系统 许华勇 蔡琳90
6.2用户登录91
6.3主界面和界面说明93
6.4模块功能列表94
第7章蛋白质序列的功能注释、分类和代谢途径分析 谭 军108
7.1蛋白质序列的功能注释108
7.2蛋白质序列的功能分类117
7.3蛋白质序列的代谢途径分析123
7.4蛋白质序列综合注释示例129
第8章ORF的搜寻及蛋白质结构预测 张忠华134
8.1 ORF的搜寻134
8.2蛋白质二级结构预测137
8.3用Swiss-model进行蛋白质三维结构预测140
8.4用PROSPECT进行蛋白质三维结构预测142
第9章 华大基因研发中心网络资源 叶 琳149
9.1 BTN简介149
9.2 PASDB简介150
9.3 RICE GD简介158
9.4 UNIBLAST简介164
9.5 HGP简介167
9.6 TTEN简介173
第10章 Bioperl简介 谭 军叶琳张忠华贾佳刘庆坡薛庆中181
10.1 引 言182
10.2 Bioperl 对象的简单介绍187
10.3 Bioperl的使用189
10.4 Bioperl辅助库（Bioperl-run,Bioperl-db等）219
10.5 附 录224