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第一章 导言1

1.1进化论是生物学中最大的统一理论1

1.2进化论是生物学对自然科学最重要的理论贡献3

1.3地球生命与地球环境协进化的概念是进化理论的新发展4

第二章 进化（演化）概念与进化生物学6

2.1时间尺度与历史自然科学6

2.2进化生物学和进化论7

2.3广义的进化概念8

2.4生物进化概念10

第三章 生物进化研究中的方法论问题12

3.1进化的因果分析12

3.2进化生物学的比较方法13

3.3自然历史资料的搜集与分析15

3.4自然进化过程的考察15

3.5进化的实验研究16

3.6关于“现实主义方法”17

第四章 进化思想与进化学说19

4.1从进化思想到进化学说19

4.2古代的自然哲学——进化思想的萌芽19

4.3中世纪西方的宗教哲学——反进化思想22

4.4近代对立的自然观与进化学说的产生23

4.5达尔文和达尔文的进化理论30

4.6达尔文以后的进化理论的发展37

4.7关于进化学说之间的争论和进化学说的分类39

第五章 地球生命与生物圈42

5.1地球是一个特殊的行星，其特殊性就在于它具有由多样生命组成的生物圈42

5.2地球生物圈的形成46

5.3为什么在太阳系中唯独地球具有生物圈49

第六章 进化的历程——生命史53

6.1生命史中的进化事件53

6.2生命史研究的新进展和新问题54

6.3生命史的三个阶段56

6.4生命起源59

6.5光合作用和光合自养生物的起源及有关的地质记录72

6.6蓝菌的繁荣与衰落74

6.7细胞进化——从原核细胞到真核细胞75

6.8元古宙晚期的生物进化事件和全球环境变化78

6.9多细胞化和后生动、植物的起源80

6.10性和有性生殖的起源89

6.11显生宙生物进化事件94

6.12动物骨骼的起源与进化94

6.13维管植物的起源与早期进化97

6.14从进化历程看形态进化趋势：复杂性和多样性的增长99

第七章 小进化102

7.1概念：什么是小进化102

7.2小进化的基本单位103

7.3种群的遗传结构103

7.4小进化因素：引起种群基因库组成变化的原因104

7.5适应106

7.6自然选择110

7.7自然选择作用下的适应进化及实证117

7.8自然选择在小进化中的作用（小结）121

7.9小进化的随机性与决定性122

7.10小进化中的内因123

7.11关于定向变异和获得性遗传126

第八章 种和种形成128

8.1物种问题128

8.2生物为什么以物种的形式存在？129

8.3物种的概念与定义130

8.4种形成135

第九章 分类系统与进化谱系144

9.1分类学与系统学144

9.2分类学的两种指导思想和两种原则145

9.3分支系统分析与进化谱系的推断147

9.4分子特征与分子进化谱系154

第十章 大进化158

10.1名词概念159

10.2大进化型式161

10.3进化速率166

10.4进化趋势173

10.5绝灭179

10.6大进化与小进化问题讨论191

第十一章 生态系统进化197

11.1生物之间的两种联系纽带和两类系统197

11.2生态系统是随时间而进化的信息系统198

11.3生态系统的组织化水平199

11.4在生态系统内的物种进化199

11.5在短时间尺度上生态系统的变化——演替202

11.6生态系统进化：在地质时间尺度上的生态系统演变203

11.7生态系统进化幕203

11.8生态系统进化的趋势206

11.9人类影响和控制下的生态系统的进化趋势——理智圈的扩展207

第十二章 分子进化和分子系统学209

12.1概念209

12.2生物大分子进化的特点209

12.3分子进化中性论：论点和论据211

12.4中性论与自然选择说是对立的吗？——关于中性论的问题讨论215

12.5分子系统学和分子系统树217

12.6古分子系统学224

12.7分子钟228

第十三章 人类的起源与进化231

13.1人类具备创造文化的三个基本条件231

13.2达尔文把人类回归到自然界232

13.3人的双重属性和人的概念232

13.4人类的形态学特征234

13.5人类的生物学进化237

13.6人类是一个多态复合种241

13.7人科谱系和现代智人种的起源242

13.8从猿到人：关于人与猿的本质区别问题248

第十四章 文化进化与人类未来250

14.1人类的生物学进化与文化进化250

14.2文化进化对人类生物学进化的影响253

14.3人类社会现象和社会行为的生物学解释——关于社会生物学问题的争议254

14.4进化与人类未来259

后记261

参考文献263