图书介绍
医学遗传学数据库资源利用实例教程PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- 赵佳，朱玉琢，刘冰译 著
- 出版社： 长春：吉林大学出版社
- ISBN：9787560194721
- 出版时间：2012
- 标注页数：157页
- 文件大小：73MB
- 文件页数：167页
- 主题词：医学遗传学－医学数据库－资源利用－教材
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图书目录
第一部分 基因信息检索篇1
案例一 应用NCBI查找BRCA1肿瘤抑制基因DNA、mRNA、cDNA、蛋白质序列1
案例二 应用NCBI查找BRCA1位点、邻近区域的基因7
案例三 应用UCSC查找ERBB2基因启动子、内含子、外显子序列和启动子CpG岛12
案例四 运用UCSC和NCBI查找已经公布的STS引物序列20
案例五 比较基因组杂交微阵列用肿瘤关联基因BRCA1对应BAC克隆的检索与选择26
案例六 利用HapMap Project检索BRCA1标签SNPs29
第二部分 基因功能挖掘篇41
案例七 利用肿瘤基因组解剖工程（CGAP）数据库筛选乳腺癌比较基因组杂交微阵列用关联基因41
案例八 利用CGAP数据库完成乳腺癌基因表达的系列分析46
案例九 利用GEO数据库挖掘乳腺癌差异表达基因54
案例十 利用KEGG PATHWAY数据库检索G6PD酶涉及的代谢途径，编码酶的基因序列（NT seq）和蛋白序列（AA seq）61
案例十一 利用KEGG PATHWAY数据库检索蛋白酶参与的代谢69
案例十二 利用KEGG数据库查询G6PD基因的同源基因71
案例十三 利用KEGG中的LinkDB查询Pentose phosphate pathway循环中涉及的所有的酶76
案例十四 人类的Pentose phosphate pathway中G6PD酶有多少化合物与其发生作用78
案例十五 利用Gene Set Analysis Toolkit V2对基因集进行富集分析80
案例十六 使用ToppGene Suite对GNAS基因相互作用基因检索90
第三部分 常见生物信息学方法应用篇95
案例十七 NCBI应用之PubMed文献检索95
案例十八 运用BLAST进行核酸序列的同源性分析108
案例十九 蛋白质氨基酸序列的同源性分析117
案例二十 BLAST完成不同物种蛋白质序列比对124
案例二十一 Primer-BLAST检验引物特异性基因序列比对133
案例二十二 PrimerPremier 5.0引物设计说明137
案例二十三 Oligo 6.0软件引物设计的使用说明144
主要参考文献155