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导论1

一、群体遗传学的内涵1

（一）基本概念1

（二）基本特性1

二、群体遗传学的发展1

（一）产生群体遗传学的理论前提1

（二）群体遗传学奠基与形成1

（三）当代群体遗传学的发展2

三、群体遗传学在遗传学中的地位与意义3

第一章 自然突变率4

一、自然突变率的直接测定4

（一）常染色体座位4

（二）性染色体座位6

二、自然突变率的间接估计7

（一）显性基因8

（二）隐性伴性基因8

（三）常染色体隐性基因9

三、蛋白质基因的自然演变率10

（一）直接测定法11

（二）蛋白质座位突变率的间接估计13

第二章 Hardy-Weinberg平衡定律应用18

一、Hardy-Weinberg定律的内涵18

二、Hardy-Weinberg平衡的若干性质19

三、斯奈德比值21

四、母子组合频率25

五、伴性基因的Hardy-Weinberg平衡28

（一）伴性基因频率分布的理论分析28

（二）对理论的检验32

第三章 基因频率的定向变化36

一、频发突变36

（一）不存在回原（反突变）的频发突变36

（二）存在回原的频发突变37

二、迁移40

三、淘汰42

（一）淘汰部分隐性类型42

（二）淘汰全部隐性类型48

（三）淘汰部分隐性类型和部分杂合子50

（四）涉及超显性的淘汰53

（五）关于淘汰的小结58

四、多因素的合并效应60

第四章 基因频率的随机变化66

一、遗传漂变的度量和性质66

（一）遗传漂变66

（二）群体有效规模70

（三）近交增量（近交率）71

（四）有限群体遗传变异消失的速度71

二、始祖效应和瓶颈效应72

（一）含义72

（二）始祖效应和瓶颈效应对家畜种群的影响72

第五章 基因频率分布与进化过程74

一、基因频率的分布函数74

二、适应进化75

（一）Wright的“适应峰”学说75

（二）适应进化论的基本主张77

（三）适应进化的可能方式77

（四）适应进化的具体演变情况78

三、分子进化79

（一）关于蛋白质分子进化速度的研究成果79

（二）各种生物蛋白质电泳分析揭示的大量多型现象81

四、关于中立说－淘汰说争论的新进展82

第六章 群体中的遗传变异85

一、遗传多型的一般概念与保持机制85

（一）一般概念85

（二）有关例证统计85

（三）遗传多型形成的概率分析86

（四）保持群体遗传多型状态的遗传学机制87

二、群体遗传变异的分析87

（一）若干基本概念87

（二）群体遗传多样性的度量方法88

（三）群体内孟德尔性状表型变异的鉴别92

三、遗传负荷97

（一）概念97

（二）遗传负荷的一般度量方法97

（三）遗传负荷的性质97

（四）遗传负荷的起因97

（五）分离负荷度量98

四、DNA多型的含义及度量98

（一）DNA多型的含义98

（二）度量方法99

五、遗传多型的进化意义100

（一）遗传多型研究对进化理论发展的贡献100

（二）DNA多型水平相对更高的遗传学基础和有关应用问题101

第七章 群体结构与系统分化103

一、群体结构模型103

（一）平面上连续分布模型103

（二）岛屿模型104

（三）2级踏脚石模型105

二、遗传分化的度量105

（一）近交度的分解105

（二）分化指数106

第八章 系统分类107

一、遗传检测的抽样方法107

（一）几种抽样方法107

（二）样本规模的影响109

（三）不同抽样方法的比较114

（四）关于抽样的实施117

二、分类依据118

（一）各种遗传标记的作用118

（二）群体间相似性度量的基本数学根据118

三、分类方法120

（一）经典聚类分析121

（二）模糊聚类分析126

（三）主成分分析——多种标记的减元并用132

（四）判别分析138

第九章 DNA与氨基酸序列的遗传演变144

一、DNA序列的遗传演变144

（一）突变144

（二）基因表达过程中密码子的使用频率145

（三）两个DNA序列间的核苷酸差异147

（四）核苷酸取代数的数学模型149

二、氨基酸序列的遗传演变155

（一）两个氨基酸序列间差异的度量155

（二）序列间差异度量值的卜瓦松校正156

（三）对PC距离的讨论——Γ距离158

第十章 分子进化与“分子进化钟”160

一、生物大分子进化的基本特点与有关学术争论160

（一）DNA高分子进化机制的研究成果160

（二）分子进化“中立论”与“新达尔文主义”争论160

二、“分子钟”假说的意义和当前有关实验证据一览161

（一）“分子钟”假说161

（二）实验证据一览161

三、分子进化相对速率检验方法162

（一）以统计学模型为基础的检验162

（二）非参数检验（不依据统计模型的检验）164

（三）以系统发育检验“分子钟”假设的方法简介166

第十一章 动物遗传资源保种方案的制订169

一、动物遗传资源保护的内涵169

二、群体遗传多样性保持的原理及保种方案的制订170

参考文献181