图书介绍
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- 施季森，童春发著 著
- 出版社： 北京：科学出版社
- ISBN：7030163664
- 出版时间：2006
- 标注页数：163页
- 文件大小：8MB
- 文件页数：172页
- 主题词：树木学：遗传学
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图书目录
0.1 林木遗传图谱构建研究的现状1
绪论1
0.2 QTL定位统计方法的研究进展5
0.2.1 数量遗传学的发展历史5
0.2.2 近交群体的QTL作图方法6
0.2.3 异交群体的QTL作图方法7
0.2.4 林木QTL作图9
上篇 遗传图谱构建的统计方法12
第1章 背景知识和基本概念12
1.1 遗传背景12
1.3 重组、干扰和遗传距离13
1.2 减数分裂13
1.4 作图函数14
1.5 实验交配群体16
1.5.1 回交群体16
1.5.2 F2群体16
1.6 极大似然法与似然比检验17
1.7 EM算法17
1.8 皮尔逊卡方统计量19
1.9 显著性检验20
1.10 分子标记数据和表型数据22
2.1.1 单位点的分离检验25
第2章 两点连锁分析25
2.1 位点的分离检验25
2.1.2 两个位点的连锁检验27
2.2 近交系两点连锁分析30
2.2.1 回交群体30
2.2.2 F2群体31
2.3 全同胞家系两位点连锁分析35
2.3.1 全同胞家系标记分离特征36
2.3.2 连锁相推断及重组率估计37
3.1 隐马尔可夫模型57
3.1.1 观测数据的概率57
第3章 多位点连锁分析57
3.1.2 重建隐状态59
3.1.3 参数估计59
3.2 回交群体数据60
3.3 F2群体数据63
3.4 全同胞数据65
第4章 连锁群划分和基因位点排序71
4.1 连锁群的划分71
4.2 三位点排序72
4.3 多位点排序73
4.3.1 多位点排序的目标函数73
4.3.2 多位点排序的计算方法74
4.4 模拟构建全同胞群体的遗传连锁图谱79
4.5 杉木遗传图谱的构建82
下篇 QTL定位的统计方法88
第5章 QTL单标记分析88
5.1 回交群体的单标记分析88
5.1.1 t检验88
5.1.2 方差分析89
5.1.3 线性回归模型91
5.1.4 极大似然法94
5.2.1 t检验97
5.2 F2群体的单标记分析97
5.2.2 方差分析99
5.2.3 回归分析100
5.2.4 极大似然法102
第6章 QTL区间作图法105
6.1 QTL基因型的条件概率105
6.2 极大似然法111
6.2.1 回交群体111
6.2.2 F2代群体113
6.3 线性回归法116
6.3.1 回交群体117
6.3.2 F2代群体118
第7章 复合区间作图122
7.1 理论基础122
7.2 回交群体作图125
7.3 F2群体作图128
第8章 异交群体的QTL作图133
8.1 半同胞群体QTL作图133
8.1.1 ANOVA方法133
8.1.2 极大似然法135
8.2 全同胞群体QTL作图137
8.3.1 Gibbs抽样141
8.3 MCMC作图141
8.3.2 Metropolis-Hastings方法142
8.3.3 MCMC方法作图143
8.4 林木F1代群体的QTL作图144
8.4.1 区间作图和复合区间作图144
8.4.2 杉木F1代群体的QTL作图145
8.4.3 讨论151
主要参考文献152
附录A 全同胞遗传连锁图谱构建软件FsLinkageMap 1.0使用说明159
A1 数据格式159
A2 数据分析159
A3 遗传连锁图谱的绘制162