图书介绍
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- 萧浪涛主编 著
- 出版社： 北京：中国农业出版社
- ISBN：710911029X
- 出版时间：2006
- 标注页数：273页
- 文件大小：95MB
- 文件页数：286页
- 主题词：
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图书目录
绪论1
一、生物信息学的定义与内容1
二、生物信息学的产生与发展4
三、生物信息学的应用5
四、生物信息学的学习方法6
思考题7
第一章 生物信息学的分子生物学基础8
第一节 生物大分子8
一、蛋白质8
二、核酸12
第二节 中心法则16
一、DNA的复制17
二、DNA到mRNA的转录17
三、遗传密码18
四、mRNA翻译为蛋白质19
五、mRNA的反转录与cDNA20
六、蛋白质的剪接20
七、蛋白质的折叠21
第三节 基因工程21
一、限制性核酸内切酶21
二、聚合酶链式反应22
三、基因克隆23
四、DNA测序方法28
第四节 基因组和蛋白质组29
一、基因组29
二、蛋白质组32
三、从基因组到蛋白质组33
思考题34
第二章 生物信息学的计算机基础35
第一节 计算机网络与国际互联网35
一、计算机网络35
二、国际互联网38
第二节 生物信息学编程基础41
一、Perl语言42
二、PHP语言47
第三节 数据库管理与数据库技术52
一、数据库管理52
二、数据库技术56
第四节 数据仓库与数据挖掘59
一、数据仓库59
二、数据挖掘61
思考题63
第三章 核酸序列分析64
第一节 核酸序列分析的意义64
第二节 算法和算法分析65
一、序列分析模型65
二、序列比对68
第三节 序列分析的实际操作81
一、DNA的碱基组成81
二、限制性核酸内切酶酶切位点分析81
三、DNA序列的数据库检索83
四、基于ClustalX的多重序列比对85
思考题87
第四章 分子进化分析88
第一节 分子进化概论88
一、分子进化的基本概念88
二、生物大分子进化的特点91
第二节 分子进化学说与遗传模型92
一、进化的分子钟92
二、分子进化的中性学说93
三、遗传模型和序列距离94
第三节 分子系统树构建95
一、距离矩阵法96
二、其他方法102
三、分子系统树构建方法的差异103
第四节 系统树的统计分析与检验104
一、树根的确定104
二、枝长和物种分歧时间的估算105
三、系统树的检验108
第五节 应用示例110
思考题114
第五章 基因组分析115
第一节 基因组学概论115
一、基因组学115
二、基因组研究概况115
第二节 结构基因组学119
一、基因组的测序原理120
二、DNA分子标记技术122
三、基因组作图125
四、基因组结构中的多态性131
第三节 功能基因组学133
一、功能基因组学的研究策略和内容133
二、功能基因组学的主要分析方法134
第四节 比较基因组学138
一、比较基因组学的基本原理138
二、比较基因组学的主要研究方法139
三、模式生物基因组的比较研究142
第五节 基因预测143
一、基因预测的方法144
二、基因组的功能注释147
三、基因预测分析的一般步骤148
思考题149
第六章 蛋白质组分析150
第一节 蛋白质组学概论150
一、蛋白质组学的概念150
二、蛋白质组分析的必要性151
三、蛋白质组分析的主要方法152
四、蛋白质组分析的技术路线和主要支持技术154
第二节 蛋白质组信息学160
一、蛋白质组信息学概述160
二、蛋白质功能分析161
三、蛋白质翻译后修饰鉴定164
四、蛋白质相互作用165
第三节 蛋白质组学的应用167
一、人类医学蛋白质组研究167
二、模式生物蛋白质组研究169
三、其他应用170
思考题170
第七章 生物芯片数据分析171
第一节 生物芯片概述171
一、生物芯片的概念171
二、生物芯片的类型172
第二节 生物芯片的制备174
一、样品的制备174
二、载体的选择及预处理174
三、芯片的制备方法175
四、点样后处理177
第三节 生物芯片反应信号检测177
一、生物芯片反应信号检测概述177
二、基于荧光标记的生物芯片反应信号检测技术178
三、基于光散射的生物芯片信号检测181
四、化学发光检测技术182
五、薄膜检测技术182
六、电化学检测技术183
第四节 生物芯片数据处理与分析183
一、生物芯片扫描图像的处理与分析184
二、数据的提取与分析187
第五节 生物芯片应用189
思考题191
第八章 核酸与蛋白质结构预测192
第一节 RNA二级结构预测192
一、RNA的二级结构与功能192
二、RNA二级结构预测195
三、RNA二级结构预测实例198
第二节 蛋白质结构预测200
一、蛋白质二级结构预测201
二、蛋白质三级结构预测207
三、蛋白质跨膜区预测211
思考题215
第九章 生物信息学平台与工具软件216
第一节 基于互联网的生物信息学平台216
一、美国国立生物技术信息中心网站216
二、欧洲分子生物学实验室网站221
三、结构生物信息学合作研究实验室网站224
四、其他生物信息学网络平台227
第二节 生物信息平台的本地化228
一、Windows环境下BLAST工具的本地化228
二、Linux环境下BLAST工具的本地化230
三、其他生物信息学平台的本地化策略230
第三节 生物信息学工具软件231
一、生物信息学集成工具软件包231
二、序列分析软件234
三、其他生物信息学工具软件235
思考题237
附录1 GenBank数据注释语238
附录2 生物信息学常用数据库241
附录3 生物信息学相关词汉英对照249
附录4 生物信息学相关词英汉对照257
参考文献265