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第一章 蟹类线粒体DNA研究概况1

1.1 蟹类线粒体DNA组成与特征1

1.2 蟹类线粒体DNA多态性及其应用3

1.2.1 线粒体DNA在蟹类分子系统学中的应用4

1.2.2 线粒体DNA在蟹类分子群体遗传学中的应用6

第二章 基于线粒体DNA的蟹类分子系统学8

2.1 基于12S rRNA基因的蟹类分子系统学9

2.1.1 基于12S rRNA基因的厚蟹分子系统分析9

2.1.2 基于12S rRNA基因的牙买加中部溪流淡水蟹类分子系统分析14

2.1.3 基于12S rRNA基因的4种青蟹分子系统分析14

2.1.4 基于12S rRNA基因的中国沿海10种方蟹分子系统分析15

2.2 基于16S rRNA基因的蟹类分子系统学18

2.2.1 基于16S rRNA基因的厚蟹分子系统分析18

2.2.2 基于16S rRNA基因的中国沿海10种方蟹分子系统分析23

2.2.3 基于16S rRNA基因的东太平洋瓷蟹分子系统分析26

2.2.4 基于16S rRNA基因的雕刻方蟹科构建27

2.2.5 基于16S rRNA基因的台南泽蟹属蟹类分类系统的分子评估29

2.2.6 基于16S rRNA基因的拟地蟹总科系统分类和生物地理学分析30

2.2.7 基于16S rRNA基因的方蟹科蟹类系统发育关系重构33

2.3 基于COI基因的蟹类分子系统学34

2.3.1 基于COI基因的厚蟹分子系统分析35

2.3.2 基于COI基因的中国沿海10种方蟹分子系统分析46

2.3.3 基于COI基因的蟹类物种厘定49

2.4 基于线粒体DNA多基因的蟹类分子系统学52

2.4.1 基于12S rRNA和16S rRNA基因的蟹类分子系统分析52

2.4.2 基于16S rRNA和COI基因的蟹类分子系统分析55

2.4.3 基于12S rRNA、16S rRNA和COI等基因的蟹类分子系统分析59

第三章 基于线粒体DNA的蟹类分子系统地理学65

3.1 基于COI基因的蟹类分子系统地理学66

3.1.1 基于COI基因的天津厚蟹和侧足厚蟹分子系统地理学66

3.1.2 基于COI基因的印度洋锯缘青蟹分子系统地理学76

3.1.3 基于COI基因的粗腿厚纹蟹群体遗传结构和分子系统地理学76

3.1.4 基于COI基因的黄色食草蟹遗传结构和分子系统地理学77

3.1.5 基于COI基因的波多黎各淡水蟹类分子系统地理学77

3.1.6 基于COI基因的中国东海三疣梭子蟹的遗传分化77

3.1.7 基于COI基因的北海道毛蟹的遗传分化和群体遗传结构78

3.1.8 基于COI基因的海南岛拟穴青蟹群体遗传多样性79

3.2 基于16S rRNA基因的蟹类分子系统地理学79

3.3 基于ND2基因的蟹类分子系统地理学81

3.4 基于Cytb和COI基因的蟹类分子系统地理学81

3.5 基于16S rRNA和COI等基因的蟹类分子系统地理学83

展望87

参考文献88